FELUDA : A FIRST CRISPR - Cas BASED RAPID DIAGNOSIS KIT WITH LOW COST AND HIGHER EFFICACY MADE IN CSIR - IGIB , DELHI INDIA.

 ? WHAT A CRISPR - Cas SYSTEM IS :

CRISPR - Cas  is  a  genome  editing  tool  that  is  creating  a  buzz  in  the  genome  editing  world  of  genetics  and  biotechnology. It  is  faster , cheaper  and  more  accurate  than  the  previous  techniques  of  editing  genome  and  has  a  wide  range  of  potential  applications. It  is  a  natural  genome  editing  system  found  in  bacteria  as  a  defence  mechanism  against  viruses  because  when  a  virus  infects  a  bacteria  it  inject  its  genome  inside  the  bacteria  and  there  the  genome  of  virus  gets  integrated  with  bacterial  genome  which  leads  to  hijacking  of  bacterial  replication  machinery  by  virus , allowing  virus  to  produce  progeny  viruses  which  leads  to  death  of  bacterial  cell. Bacteria  by using  CRISPR  snips  out  parts  of  virus  genome  and  keep  a  bit  of  it  behind  to  help  them  recognise  and  defend  against  the  virus  next  time  it  attack. CRISPR  stands  for  the  Clustered  Regularly  Interspaced  Short  Palindromic  Repeats  where  as  Cas  stands  for  the  CRISPR  associated  proteins. The  CRISPR - Cas  system  consists  of  two  key  molecules  that  introduce  a  change  into  the  genome.

1. Cas Enzyme : Cas  is  an  endonuclease  enzyme ( molecular  scissors )  that  can  cut  the  two  strands  of  DNA  at  a  specific  location  in  the  genome  so  that  bits  of  genome  can  than  be  added  or  removed. Cas  follows  the  guide  RNA  to  the  target  site  in  the  genome  where  it  makes  a  cut  across  both  strands  of  the  DNA. 

    

2. Guide RNA : Guide  RNA  consists  of  a  small  piece  of  pre - designed  RNA  sequence  of  about  20  bases  long  located  within  a  longer  RNA  scaffold  which  are  complementary  to  the  target  site  of  genome. The  scaffold  part  binds  to  the  genome  and  the  pre - designed  sequence  guides  Cas  to  the  right  part  of  the  genome. This  makes  sure  that  the Cas  enzyme  cuts  at  the  right  points  in  the  genome.

#  CRISPR  sequences  were  first  discovered  in  bacteria  Escherichia .coli  by  researcher "Yoshizumi  Ishino"  and  his  colleagues  in  1987. But  CRISPR - Cas  as  a  genome  editing  tool  was  first  proposed  by " Doudna "  and " Emmanuelle  Charpentier " in  2012.

FELUDA TEST KIT :

Senior  scientists  Dr.  Debojyoti  Chakraborty  and  Dr.  Souvik  Maiti  at  CSIR - IGIB , Delhi  for  the  first  time  invented  a  CRISPR - Cas  based  rapid  diagnosis  kit  for  covid  infection  detection  named  as  " FELUDA " ( FnCas9  Editor  Linked  Uniform  Detection  Assay ). Feluda  is  a  paper  strip  based  diagnosis  kit  that  works  by  combining  CRISPR  system  and  paper  strip  Chemistry. The  paper  based  diagnosis  test  is  similar  to  mechanism  of  a  pregnancy  test  kit  where  we  dip  the  paper  strip  in  the  solution  and  colour  changes. The  strip  consist  of  two  lines :

• Control  line  which  is  present  in  the  every  strip  that  is  being  used  and  indicates  that  the  strip  is  working  proper.
• Test  line  which  comes  positive  (coloured ) when  there  is  suspected  agent  of  the  covid  infection  in  the  sample  and  vice - versa.

COST OF KIT : 500  rupees  for  a  single  kit  which  is  more  cheaper  than  the  RT - PCR  test  which  cost  around  4,500  rupees.

TIME REQUIRED : less  than  one  hour  around  30  minutes  where  on  the  other  hand  RT - PCR  takes  4 to 6  hours  for  single  sample.

EFFICACY : Have  excellent  efficacy  as  that  of  RT - PCR.